HLA TSV Full

gene    num_alleles     allele_1        reads_supporting_allele_1       EM_posterior_allele_1   allele_2        reads_supporting_allele_2       EM_posterior_allele_2   Notes
A       1       A*32:01 1227    1.000000        NA      NA      NA      NA
B       1       B*15:01 1158    1.000000        NA      NA      NA      NA
C       2       C*03:03 1361    0.770833        C*03:04 1310    0.229167        NA
DMA     1       DMA*01:01       1833    1.000000        NA      NA      NA      NA
DMB     1       DMB*01:01       2247    0.975507        NA      NA      NA      NA
DOA     1       DOA*01:01       1497    1.000000        NA      NA      NA      NA
DOB     1       DOB*01:01       1769    1.000000        NA      NA      NA      NA
DPA1    1       DPA1*01:03      3411    1.000000        NA      NA      NA      NA
DPA2    2       DPA2*01:01      2560    0.562016        DPA2*02:01      2528    0.437984        NA
DPB1    2       DPB1*02:01      4360    0.443701        DPB1*31:01      3013    0.151119        NA
DPB2    2       DPB2*01:01      5734    0.749003        DPB2*03:01      3784    0.242016        NA
DQA1    2       DQA1*01:01      1869    0.740983        DQA1*06:01      603     0.225755        NA
DQA2    1       DQA2*01:01      2301    0.988328        NA      NA      NA      NA
DQB1    2       DQB1*05:01      2129    0.751502        DQB1*03:01      719     0.248498        NA
DQB2    1       DQB2*01:01      2768    1.000000        NA      NA      NA      NA
DRA     2       DRA*01:01       1876    0.814725        DRA*01:03       1098    0.185275        NA
DRB1    2       DRB1*01:01      779     0.731210        DRB1*08:03      290     0.171451        NA
DRB5    2       DRB5*02:02      49      0.608936        DRB5*02:21      33      0.291917        Allele1:LowSupportingReads Allele2:LowSupportingReads
E       2       E*01:03 1402    0.793814        E*01:01 1345    0.206186        NA
F       1       F*01:01 1420    1.000000        NA      NA      NA      NA
G       1       G*01:01 1361    0.971827        NA      NA      NA      NA
H       1       H*02:03 1386    1.000000        NA      NA      NA      NA
J       1       J*01:01 1526    0.998765        NA      NA      NA      NA
K       1       K*01:01 1403    0.990965        NA      NA      NA      NA
L       1       L*01:01 1378    0.996270        NA      NA      NA      NA
N       1       N*01:01 209     1.000000        NA      NA      NA      NA
P       1       P*02:01 1192    0.999039        NA      NA      NA      NA
S       2       S*01:04 314     0.809390        S*01:02 183     0.153795        NA
T       1       T*02:01 919     0.956639        NA      NA      NA      NA
U       2       U*01:02 208     0.721489        U*01:03 71      0.215357        NA
V       1       V*01:01 794     1.000000        NA      NA      NA      NA
W       2       W*04:01 1026    0.825142        W*02:01 664     0.168624        NA
MICA    1       MICA*010:01     5188    1.000000        NA      NA      NA      NA
MICB    2       MICB*005:02     4603    0.630347        MICB*019:01     4283    0.298161        NA
TAP1    1       TAP1*01:01      3380    0.999999        NA      NA      NA      NA
TAP2    2       TAP2*02:01      3481    0.544792        TAP2*01:01      3308    0.374378        NA
HFE     1       HFE*001:01      3       1.000000        NA      NA      NA      Allele1:LowSupportingReads
DRB3    0       NA      NA      NA      NA      NA      NA      NA
DRB4    1       DRB4*01:183     20      0.125000        NA      NA      NA      Allele1:LowSupportingReads
Y       0       NA      NA      NA      NA      NA      NA      NA
R       0       NA      NA      NA      NA      NA      NA      NA

Last updated

Was this helpful?