HLA TSV Full
gene num_alleles allele_1 reads_supporting_allele_1 EM_posterior_allele_1 allele_2 reads_supporting_allele_2 EM_posterior_allele_2 Notes
A 1 A*32:01 1227 1.000000 NA NA NA NA
B 1 B*15:01 1158 1.000000 NA NA NA NA
C 2 C*03:03 1361 0.770833 C*03:04 1310 0.229167 NA
DMA 1 DMA*01:01 1833 1.000000 NA NA NA NA
DMB 1 DMB*01:01 2247 0.975507 NA NA NA NA
DOA 1 DOA*01:01 1497 1.000000 NA NA NA NA
DOB 1 DOB*01:01 1769 1.000000 NA NA NA NA
DPA1 1 DPA1*01:03 3411 1.000000 NA NA NA NA
DPA2 2 DPA2*01:01 2560 0.562016 DPA2*02:01 2528 0.437984 NA
DPB1 2 DPB1*02:01 4360 0.443701 DPB1*31:01 3013 0.151119 NA
DPB2 2 DPB2*01:01 5734 0.749003 DPB2*03:01 3784 0.242016 NA
DQA1 2 DQA1*01:01 1869 0.740983 DQA1*06:01 603 0.225755 NA
DQA2 1 DQA2*01:01 2301 0.988328 NA NA NA NA
DQB1 2 DQB1*05:01 2129 0.751502 DQB1*03:01 719 0.248498 NA
DQB2 1 DQB2*01:01 2768 1.000000 NA NA NA NA
DRA 2 DRA*01:01 1876 0.814725 DRA*01:03 1098 0.185275 NA
DRB1 2 DRB1*01:01 779 0.731210 DRB1*08:03 290 0.171451 NA
DRB5 2 DRB5*02:02 49 0.608936 DRB5*02:21 33 0.291917 Allele1:LowSupportingReads Allele2:LowSupportingReads
E 2 E*01:03 1402 0.793814 E*01:01 1345 0.206186 NA
F 1 F*01:01 1420 1.000000 NA NA NA NA
G 1 G*01:01 1361 0.971827 NA NA NA NA
H 1 H*02:03 1386 1.000000 NA NA NA NA
J 1 J*01:01 1526 0.998765 NA NA NA NA
K 1 K*01:01 1403 0.990965 NA NA NA NA
L 1 L*01:01 1378 0.996270 NA NA NA NA
N 1 N*01:01 209 1.000000 NA NA NA NA
P 1 P*02:01 1192 0.999039 NA NA NA NA
S 2 S*01:04 314 0.809390 S*01:02 183 0.153795 NA
T 1 T*02:01 919 0.956639 NA NA NA NA
U 2 U*01:02 208 0.721489 U*01:03 71 0.215357 NA
V 1 V*01:01 794 1.000000 NA NA NA NA
W 2 W*04:01 1026 0.825142 W*02:01 664 0.168624 NA
MICA 1 MICA*010:01 5188 1.000000 NA NA NA NA
MICB 2 MICB*005:02 4603 0.630347 MICB*019:01 4283 0.298161 NA
TAP1 1 TAP1*01:01 3380 0.999999 NA NA NA NA
TAP2 2 TAP2*02:01 3481 0.544792 TAP2*01:01 3308 0.374378 NA
HFE 1 HFE*001:01 3 1.000000 NA NA NA Allele1:LowSupportingReads
DRB3 0 NA NA NA NA NA NA NA
DRB4 1 DRB4*01:183 20 0.125000 NA NA NA Allele1:LowSupportingReads
Y 0 NA NA NA NA NA NA NA
R 0 NA NA NA NA NA NA NALast updated
Was this helpful?
